Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrfip1Q3UZ39 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms