Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C87499Q3UX49 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C87499Q3UX49 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms