Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slfn4Q3UV66 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms