Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Eb2Q3UUV9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms