Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm10Q3UTQ7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm10Q3UTQ7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm10Q3UTQ7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm10Q3UTQ7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm10Q3UTQ7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm10Q3UTQ7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm10Q3UTQ7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm10Q3UTQ7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm10Q3UTQ7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm10Q3UTQ7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm10Q3UTQ7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm10Q3UTQ7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm10Q3UTQ7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm10Q3UTQ7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm10Q3UTQ7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm10Q3UTQ7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms