Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cobll1Q3UMF0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms