Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms