Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms