Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc61Q3UJV1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms