Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sf3b2Q3UJB0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms