Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms