Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam35aQ3UEN2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam35aQ3UEN2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms