Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms