Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ulk3Q3U3Q1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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