Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms