Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srsf6Q3TWW8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Srsf6Q3TWW8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Srsf6Q3TWW8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Srsf6Q3TWW8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Srsf6Q3TWW8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Srsf6Q3TWW8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Srsf6Q3TWW8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Srsf6Q3TWW8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms