Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

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Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnnm2Q3TWN3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms