Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TchpQ3TVW5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms