Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21440Q3TTD8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms