Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdnep1Q3TP92 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms