Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms