Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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