Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3KNL4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3KNL4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3KNL4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3KNL4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3KNL4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms