Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms