Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms