Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sap25Q1EHW4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sap25Q1EHW4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms