Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms