Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms