Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli2Q0VGT2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms