Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms