Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83bQ0VBM2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83bQ0VBM2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms