Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StumQ0VBF8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms