Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms