Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc21bQ0HA38 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms