Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms