Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb2Q08331 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms