Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou6f1Q07916 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms