Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms