Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NrepQ07475 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NrepQ07475 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms