Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms