Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms