Protein–RNA interactions for Protein: Q05BQ1

Igsf9, Protein turtle homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9Q05BQ1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Igsf9Q05BQ1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igsf9Q05BQ1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms