Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox13Q04891 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms