Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms