Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme2Q01768 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms