Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp1Q01514 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms