Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EgfrQ01279 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms