Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmgcrQ01237 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms