Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms