Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrcdQ00LT2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms